ChapterDx SARS-CoV-2 NGS Testi

ChapterDx COVID-19 NGS testi, tek tüp ve tek RT-PCR reaksiyonunda SARS-CoV-2 genomunun 7 farklı hedefini saptayan, dizileyen ve kantifikasyon gerçekleştirenbir teknolojidir. Yüksek doğrulukla viral sürveyansı izler ve ayrıca SARS-CoV ve Bat CoV'yi tespit eder. Daha da önemlisi, enfeksiyonun yayılmasına katkıda bulunan yanlış negatif sonuçlarla karakterize örnekleri tanımlar.

ChapterDx COVID-19 NGS testi aşağıdaki adımlardan oluşur:

• i) RNA ekstraksiyonu;
• ii) Multipleks RT-PCR;
• iii) Havuzlama ve saflaştırma;
• iv) Yeni nesil dizileme.

RT-PCR reaksiyonunda, her örneğin hem amplifikasyonu hem de indekslenmesi/barkodlanması aynı anda gerçekleşir. RT-PCR'den sonra tüm amplikonlar tek bir tüpte toplanır. Bu noktadan sonraki prosedür numune numarasından bağımsız olarak yalnızca tek tüpte ilerler. Örnek temizleme adımından sonra kütüphane, bir Illumina sıralama platformunda dizilenmektedir. MiniSeq Mid Outputkiti için numune kapasitesi minimum 1.600'dür. Tüm iş akışı yaklaşık 24 saat sürer, bunun yaklaşık 6 saati laboratuvar çalışması/inkübasyon süresi ve 17 saati dizilemeden oluşur. Veri analizi yalınızca 10 dakika sürer.

• SARS-CoV-2'nin 7 bölgesinin eş zamanlı tespiti
• Tek tüp ve tek RT-PCR reaksiyon testi
• ORF1a, ORF1b, S ve ORF3 üzerinde bulunan hedefler
• 4 korunmuş ve 3 değişken bölge
• Viral sürveyans (enfeksiyon kaynağının izlenmesi)
• SARS ve Bat-CoV'yi algılar
• Kullanıcı dostu iş akışı ve otomatikleştirilmesi kolay
• Orta ve yüksek verimli ölçekler için uygun
• Yüksek duyarlılık ve özgüllük
• Doğru kantifikasyon
• Düşük maliyetli